液相色譜儀與氣相色譜儀的進樣方式、流動相、流動相與樣品的作用、流動相粘度、流動相流動壓力、固定相粒度、柱溫、樣品回收和應用範圍等技術指標的差別如下：
一、進樣方式：
1、液相色譜儀：樣品製成溶液。
2、氣相色譜儀：樣品需加熱氣化或裂解且不分解。
二、流動相：
1、液相色譜儀：可選用不同性質的各種溶劑。
2、氣相色譜儀：惰性氣體。
三、流動相與樣品的作用：
1、液相色譜儀： 可發生作用，能改善分離選擇性。
2、氣相色譜儀：不發生作用。
四、流動相粘度：
1、液相色譜儀：10ˉ3Pa·S
2、氣相色譜儀：10ˉ5Pa·S
五、流動相流動壓力：
1、液相色譜儀：2～20MPa
2、氣相色譜儀：1～0.5MPa
六、固定相粒度：
1、液相色譜儀：5～10um
2、氣相色譜儀：0.1～0.5mm
七、柱溫：
1、液相色譜儀：常溫
2、氣相色譜儀：常溫～300℃
八、樣品回收：
1、液相色譜儀：容易且可定量，適合大量製備。
2、氣相色譜儀：困難。
九、應用範圍：
1、液相色譜儀：沸點高、極性強、穩定性差、分子量大的化合物和離子化合物。
2、氣相色譜儀：穩定性好和易氣化的化合物。
